snapgene
產(chǎn)品編號(hào)：132535
當(dāng)前版本：
開 發(fā) 商：GSL Biotech
產(chǎn)品類型：應(yīng)用軟件類型
產(chǎn)品功能：生物學(xué)制圖
開發(fā)平臺(tái)：Visual Studio 2005 / Visual Studio 2008
其他特性：Web Form / Windows Form / 兼容Sharepoint / Ajax支持
產(chǎn)品源碼：不提供源碼
產(chǎn)品介紹：
SnapGene 是一個(gè)直觀允許用戶分析和修改 DNA圖譜的應(yīng)用程序,并將它們導(dǎo)出到其他 fomats.由于這個(gè)軟件,分子生物學(xué)家有可能使,探索或共享共享詳細(xì)的 DNA 序列文件.
產(chǎn)品功能：
1.可視化
DNA可視化
查看DNA序列的多個(gè)視圖。
地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史
自定義酶位點(diǎn)，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。
查看 · 搜索 · 縮放
利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。
查看蛋白質(zhì)序列的多個(gè)視圖。
地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史
自定義區(qū)域，站點(diǎn)，鍵和序列顏色的顯示。
輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。
標(biāo)準(zhǔn)編輯 · DNA結(jié)束
進(jìn)行插入，刪除，替換和大小寫更改。復(fù)制并粘貼序列時(shí)，會(huì)自動(dòng)傳輸功能。
將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為十種顏色之一。
給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見。
自動(dòng)注釋常用功能，或手動(dòng)注釋新功能。
自動(dòng)特征檢測 · 手動(dòng)特征注釋
使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的常見特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫中。
2.模擬
確認(rèn)限制性網(wǎng)站適合克隆。
獨(dú)特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質(zhì)
以粗體顯示獨(dú)特的限制性位點(diǎn)，或選擇自動(dòng)定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。
可視化克隆過程的所有方面。
如果您已經(jīng)考慮過程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計(jì)缺陷，則可以捕獲并糾正錯(cuò)誤。
模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR。
使用您自己的引物，或要求SnapGene自動(dòng)設(shè)計(jì)引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲(chǔ)模板和引物。
通過重疊延伸PCR融合片段。
多可組裝八個(gè)片段。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。
使用誘變引物進(jìn)行定點(diǎn)誘變。
選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。
模擬網(wǎng)關(guān)® BP克隆或LR克隆，或兩者在同一時(shí)間。
為方便起見，提供了常見的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。
通過融合多達(dá)八個(gè)片段或通過將多達(dá)八個(gè)片段插入向量來模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。
選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。
通過在向量中插入 多八個(gè)片段來模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法，可用于創(chuàng)建無縫基因融合。
選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。
通過TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。
選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效GC克隆。
為方便起見，提供了常見的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。
退火兩個(gè)寡核苷酸形成雙鏈產(chǎn)物。使用簡單的控件添加突出限制克隆
3.規(guī)避錯(cuò)誤
閱讀基因融合的框架
確保構(gòu)造中的已轉(zhuǎn)換要素符合框架。使用“序列”視圖可以快速查看兩個(gè)已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣，翻譯鏈接在同一行。如果不是，則翻譯在單獨(dú)的行上。
與參考序列對(duì)齊
使用強(qiáng)大的對(duì)齊工具檢查實(shí)際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。
4.自動(dòng)錄制
全面的“撤銷”能力
幾乎撤消任何操作。不要害怕嘗試使用SnapGene文件 - 回溯您的步驟很容易。
歷史和嵌入式祖先
查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。單擊操作以突出顯示親本和產(chǎn)物序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。
單擊歷史記錄樹中的祖先以重新生成該祖先序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。
歷史色彩
使用可選的歷史記錄顏色來標(biāo)識(shí)序列的 新更改。
5.數(shù)據(jù)
安全文件管理
將SnapGene文件保存在所需的位置。使用熟悉的安全操作系統(tǒng)來存儲(chǔ)和整理SnapGene文件。
從其他格式導(dǎo)入
閱讀許多常見的文件格式。不僅可以導(dǎo)入DNA序列，還可以導(dǎo)入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開發(fā)進(jìn)口商，以確保您不會(huì)被鎖定為專有文件格式。
導(dǎo)出為標(biāo)準(zhǔn)格式
將序列，地圖或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)格式，以便與其他軟件一起使用。將序列導(dǎo)出為GenBank或FASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導(dǎo)出為常見的圖像格式。
使用SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)
將SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費(fèi)SnapGene Viewer的同事或客戶。只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖，序列和注釋，就像在完整的SnapGene界面中一樣。
6.轉(zhuǎn)換文件格式
開放式信息交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了讀取和導(dǎo)出常見文件格式的選項(xiàng)。
從其他格式導(dǎo)入時(shí)，目標(biāo)不僅是捕獲DNA序列，還捕獲注釋和注釋。
